3/28/2013

FlowJo vX - 10.0.6 r2(10.0.6 修正パッチ)

FlowJo vX - 10.0.6の修正パッチがリリースされています。
機能的に目立つ修正ではありませんが、アップデート推奨です。
こちらからダウンロードできます。

修正箇所
  • [About FlowJo]を開いた時のメモリーリークの不具合を修正しました。
  • v10.0.6(Windows版)からインストールされるようになったFlowJo診断ツールの変数を一部変更しました。

3/26/2013

FlowJo vX - 10.0.6

FlowJo vX - 10.0.6がリリースされています。

修正箇所
  • 3D表示の不具合を修正しました。
  • Command line execution has received much attention to streamline execution and improve performance.
  • Command line execution was implemented in layout-batches to speed those up
  • [コンペンセーションマトリックスエディター]に関して、v10.0.0リリース以降に寄せられたユーザーフィードバックをもとに大幅に修正をしました。
  • [コンペンセーションエディター]の改良、デザイン変更を行いました。
  • ACS container has received some attention, so that opening an ACS and saving back to it works a lot better.
  • v9のJO形式のファイルの読み込みが改善されました。
  • WSP file opening - much time was spent on the bug discovered in 10.0.5 where saved .wsp files were no longer openable if compensation was invovled. We fixed the bug as well as opening those saved workspaces, among a pile of other fixes in this area.
  • Influx, Moflo, Astrios, and other "non-Diva" formats have been worked on so their reading into FJ looks better now.
  • Graph window and gating have received many improvements and bug fixes, from quads to manual gating.
  • Also the aesthetics and preferences used by graphs have been improved.
  • we made another pass on "internationalization" support in FJ, splitting "language" and "country" into two different preferences.
  • Layout Charting, Editing, and Iteration have all received passes improving perfomance and aesthetics.
  • Scale for layout overlay Y axis has been worked on.
  • A lot of work on licensing, proxy and preferences interaction
  • plate editor has been put back into FJ and received some overhaul. This will continue to evolve in the next immediate releases.
  • numerous preferences were found to not work or not be clear. fixed.
  • refresh issues were fixed where various windows would not repaint with new information.
  • many keyboard shortcuts were fixed
  • table editor has received a pass of 26 minor bug fixes, ranging from default output to time series.
  • workspace window operation have been streamlined for perfmance and robustness, 38 minor fixes.
新機能
  • new documentation website. check it out! http://docs.flowjo.com/
  • command line batching is now an option in the layout editor (faster.)
  • population comparison, kinetics and plate editor platforms are back
  • FlowJo diagnostic tool (windows only for now) - helps diagnose and report properties which are difficult to look up manually.
既知の不具合
  • for Serial Number users - License Screen doesn't enable the "Done" button until you click the "use serial number" button
  • linux version won't ship at the same time as win/osx, but we are working on it.

3/08/2013

フローサイトメトリートレーニングコース

トミーデジタルバイオロジー株式会社が主催するビギナー向けフローサイトメトリートレーニングコースです。こちらから申込み可能です。

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本トレーニングコースはフローサイトメトリーに慣れていない研究者がフローサイトメトリーを扱う上で理解しておくべき基本的な内容をセミナー形式で解説します。

【内容】
・フローサイトメトリーの原理
・コンペンセーション
・コントロールの考え方
・パネルのデザイン
・データ解析

2013年4月4日(木)
9:30‐16:45(9:15受付開始)
参加費3万円(昼食費を含み、消費税を含みません。)

FlowJoトレーニングワークショップ

トミーデジタルバイオロジー株式会社が主催するFlowJoトレーニングワークショップです。
こちらから申込み可能です。Mac版とWindows版に分かれています。

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本トレーニングではセミナー形式のトレーニングでFlowJoの基本使用方法はもちろんのこと、知っていて得する、効率的にフロージョーを使いこなすためのFlowJoTipsについてもご紹介いたします。

内容
・FCSデータのインポート(FCS2.0、3.0インポート時の違い)
・FlowJoの基本的な操作
各種グラフ表示
各種ゲーティングツール
レイアウトエディターの使用方法
テーブルエディターの使用方法
・コンペンセイション(DiVaデータの読み込み)
セミナー終了後にFAQをお受けしたり、実際にFlowJoをご利用いただくことも可能です。
本セミナーでは論文作成、プレゼンテーション用資料作成時等に
便利な使い方、Tips等も含めご紹介いたします。

1/25/2013

FlowJo Basic Tutorial Movies

FlowJo vXのベーシックチュートリアルが13パート構成でYouTubeにアップされています。
ご興味のある方は TreeStar360's channel をチェックしてください。

12/26/2012

FlowJo vX 既知のバグリスト

2012年12月26日(FlowJo vX 10.0.5)時点
  • ワークスペースにおいて、FCSキーワードの"Collection time"で並べ替えすることはできません。
  • Windows 7上で使用する場合、スクロースした際にリストが表示されなくなります。この不具合はJava 7を利用している場合に発生します。
  • グループにゲーティングを適用した場合に[Redo]の操作で不具合が発生します。
  • テキストボックスで形式の選択で不具合が発生します。
  • 相関プロットやラインプロットはボタン操作で正常に表示されません。バッチ処理した表でプロットを作成する場合には、マウスの右クリックして表示されるサブメニューから選択します。
  • ゲートウィンドウから直接印刷する場合、背景はレイアウトエディターの背景を利用して印刷されます。
  • ヘッダ/フッタのプリファレンスは正常に動作しません。
  • オフセットヒストグラムの上部はレイアウトエディターにおいてカットオフされてしまいます。
  • PowerPointプレゼンテーションスライドに直接追加することはできません。
  • [Save as PDF]は不具合が発生します。[Batch to PDF]を利用してください。
  • [Backgating]や[Multigraph Overlays]を複数プロットに追加しても1つのプロットだけにしか追加されません。
  • [Save graphic as SVG]は正常に動作しません。
  • Bisectorゲート上での統計演算はプロットの中央に表示されます。
  • 英語以外の言語を使用して保存したワークスペースファイルを読み込む際に不具合が発生します。
  • JO形式のファイルを読み込む際に、[Ancestry]、[Backgating]、[Combination gates]は正常に動作しません。
  • ミルテニー社製フローサイトメーターで生成されたFCS3.1ファイルのコンペンセイションパラメーターに不具合があり、正しく読み込むことができません。
  • [3D]が反応しません。

12/21/2012

FlowJo vX - 10.0.5

FlowJo vX - 10.0.5がリリースされています。

今回の変更点は以下の通りです。
意味不明な項目については英文のままで記載しています。確認ができ次第、和訳していきます。
  • ブーリアン[Not]ゲートの不具合を修正しました。
  • マトリックスエディターを開く際の不具合を修正しました。
  • Derived Parametersをキャンセルする際の不具合を修正しました。
  • 保存したACSファイルを開く際のコンペンセーションに関する不具合を修正しました。
  • コンペンセーションと試薬名をWSPファイルに保存できるようになりました。
  • Guavaから生成されたファイルでのコンペンセーションの不具合を修正しました。
  • BD製InFluxセルソーターから生成されたファイルを取り込むことができるようになりました。
  • ゲートウィンドウでゲートを半透明の塗りつぶしができるようになりました。
  • Bisector gates can now be created on samples with the same stain
  • Synchronizedゲートがマグネティックゲート一緒に動作するようになりました。
  • 対数パラメーター上でゲートを移動させた際にゲートが消えてしまう不具合を修正しました。
  • グリッドに一度に2つ以上のサンプルを追加できるようになりました。
  • Windows 8にインストールできるようになりました。
  • ローカライゼーションフラグが削除されました。言語設定の変更はプリファレンスで行なってください。
  • レイアウトエディターでレイアウトが削除されてしまう不具合を修正しました。
  • レイアウトエディターでのコントロールサンプルとのオーバーレイバッチ処理、統計演算、FCSキーワードに関する一連の不具合を修正しました。
  • ワークスペースとレイアウトエディターでの印刷の不具合を修正しました。
  • 統計演算関数にRobust標準偏差が追加されました。
  • レイアウトエディターでゲートがドラッグされた際に統計演算関するの"Freq. of.."が正常に演算されるようになりました。
  • テーブルエディターのヘッダ/フッタが正常に動作するようになりました。
  • テーブルエディターでデフォルト設定を変更せずに列を編集することができるようになりました。
  • テーブルエディターで列の名称にFCSキーワードを使えるようになりました。
  • テーブルエディターで相関プロットやラインプロットを作成できるようになりました。
  • レイアウトエディターで統計演算ボックスを追加したり、編集したりできるようになりました。
  • レイアウトエディター上でダブルクリックするとFJMLにアクセスできるようになりました。
  • 子階層のゲートをグループにドラッグ・アンド・ドロップした際に正常に反映されるようになりました。
  • ワークスペース上でマウスの右クリックで表示されるサブメニューから[コピー]を選択できるようになりました。
  • Can now save group export in a template and run via command line
  • 開示三角形のクリック位置が中心になりました。